内蒙古工业大学生物工程专业于2000年设立，2009年被评为内蒙古自治区级“品牌专业”，2022年获批自治区级“一流”本科专业建设点。生物工程专业现有教师14人，其中副高以上职称教师8人。专业近五年建设自治区级优秀教学团队1个，建设校级优秀教学团队2个；建设自治区级“一流课程”1门、“精品课程”2门；获批科研项目40余项，教改项目10余项；发表论文100余篇，出版教材3部，发明专利20余项；获自治区教学成果二等奖1项、自治区“青年创新人才”1人，“内蒙古青年科技奖”1项。依托生物工程专业成立了3 个自治区级工程中心，1个研发与中试平台，1个自治区产业创新团队。经历了20余年的建设，形成了立足区域重点产业培养人才的专业特色，年招生规模为70人。毕业生可在生物医药、生物化工、生物资源利用等生物工程相关领域、政府部门、科研院所等从事研发、设计、生产、管理等工作。